(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210636258.5 (22)申请日 2022.06.07 (71)申请人 北京大学第一医院 地址 100034 北京市西城区西什库大街8 号， 北京大 学第一医院 (72)发明人 张宁　杨慧　程景辉　吴健民　 庄昊　 (74)专利代理 机构 北京国林贸知识产权代理有 限公司 1 1001 专利代理师 李瑾　李连生 (51)Int.Cl. C12Q 1/6886(2018.01) A61K 31/44(2006.01) A61P 35/00(2006.01) (54)发明名称 索拉非尼耐药分子标记物及其相关试剂的 应用 (57)摘要 本发明公开了一种索拉非尼耐药分子标记 物及其相关试剂应用。 所述索拉非尼耐药标记物 为CTNNB1或者是与CTNNB1相关联的一组标记物 中的任意一种， 所述与CT NNB1相关联的一组标记 物为PIK3CA、 HNRNPUL2 ‑BSCL2、 PAXIP1、 CDKL5、 LZTFL1、 S1PR2、 KLHL11、 RP11 ‑159G9.5、 FAM171A2、 ZBED6、 PELI1、 PRIM1。 上述索拉非尼耐 药标记物可用于预测索拉非尼的药效。 通过对肝 癌患者的组织转录组测序， 或通过PCR、 基因芯 片、 组织芯片、 NanoString技术、 免疫组化的方法 检测相关分子的表达， 可为索拉非尼的用药与肝 癌的精准治 疗提供线索。 权利要求书1页 说明书5页 附图5页 CN 114959035 A 2022.08.30 CN 114959035 A 1.一种索拉非尼耐药标记物， 其特征在于， 所述索拉非尼耐药标记物为CTNNB1或者是 与CTNNB1相关联的一组标记物中的任意一种， 所述与CTNNB1相关联的一组标记物为 PIK3CA、 HNRNPUL2 ‑BSCL2、 PAXIP1、 CDKL5、 LZTFL1、 S1PR2、 KLHL11、 RP11 ‑159G9.5、 FAM171A2、 ZBED6、 PEL I1、 PRIM1。 2.根据权利 要求1所述的索拉非尼耐药标记物， 其特征在于： 为RNA或其逆转录的cDNA， 或蛋白。 3.权利要求1所述索拉非尼耐药 标记物在非治疗目的 的索拉非尼用药研究中的应用。 4.检测权利要求1中所述索拉非尼耐药标记物表达量的定量试剂在制备索拉非尼耐药 评估试剂及药 敏检测试剂中的应用。 5.根据权利要求4所述的应用， 所述索拉非尼耐药评估试剂及药敏检测试剂为索拉非 尼在治疗肝癌过程中进行耐药评估及药敏检测的试剂， 所述耐药评估及药敏检测的样本为 患者肝癌组织； 所述定量试剂为转录组测序试剂、 PCR、 基因芯片、 组织芯片、 NanoString技 术、 免疫组化试剂中任意 一种。 6.一种索 拉非尼耐药性评估试剂 盒， 其特征在于： 包含检测权利要求1中所述索拉非尼 耐药标记物表达量的定量试剂。 7.一种原发性 肝癌的索拉非尼耐药分析系统， 其特 征在于， 包括： 靶点表达量检测装置： 用于检测样本 中权利要求1所述索拉非尼耐药标记物的表达量； 所述样本为患者 肝癌组织； 耐药分析装置： 基于索拉非尼耐药 标记物的表达量， 确定肝癌的用药效果； 结果输出装置： 用于 输出耐药分析装置分析 得到的结果。 8.根据权利要求6所述的索 拉非尼耐药分析系统， 其特征在于： 所述靶点表达量检测装 置采用的试剂包括组织转录组测序， 或通过PCR、 基因芯片、 组织芯片、 NanoString技术、 免 疫组化试剂中任意 一种或几种。 9.抑制权利要求1所述索 拉非尼耐药标记物表达的药物在制备治疗肝癌的药物组合物 中的应用， 所述药物组合物中包 含有索拉非尼。 10.一种治疗肝癌的药物组合物， 其特征在于： 包含索拉非尼及抑制权利要求1所述索 拉非尼耐药 标记物表达的药物。权　利　要　求　书 1/1 页 2 CN 114959035 A 2索拉非尼耐药分子标记物及其相关试剂的应用 技术领域 [0001]本发明属于生物医学技术领域， 尤其涉及肿瘤领域， 具体为一种索拉非尼耐药分 子标记物及其相关试剂应用。 背景技术 [0002]原发性肝癌(Primary  liver cancer， PLC)在我国目前常见的恶性肿瘤中， 发病率 排第四位， 死亡率排第二位， 严重威胁我国人民的生命和健康。 肝癌早期患者(巴塞罗纳0期 A期)， 手术切除和肝移植等治疗可以有效地提高肝癌患者的治愈率和生存预后。 然而由于 肝癌起病隐匿， 早期症状缺乏特异性， 很多患者被诊断为肝癌时， 就已经处于中期或晚期。 长期以来， 由于药物治疗方案少， 而且临床有效率低， 中晚期肝癌普遍显示预后差、 生存率 低。 [0003]索拉非尼(Sorafenib)是最早用于肝癌治疗药物， 可作用于CRAF、 BRAF、 V600EBRAF、 c ‑Kit、 FLT‑3、 VEGFR‑2、 VEGFR‑3、 PDGFR‑β 靶点， 起到抑制肿瘤细胞增殖和抗血 管生成作用。 然而， 索拉非尼仅能将中位生存期提高三个月， 且有效率低， 尚不 足10％、 而且 出现了很多无效治疗现象。 因此， 亟需索拉非尼的药 敏分子分型 方案， 提高肝癌治疗 疗效。 发明内容 [0004]为了克服现有技术的问题， 本发明的第一个目的在于提供一种索拉非尼耐药标记 物， 采用其可对索拉非尼耐药人群进 行提示， 为肝癌精准治疗提供依据。 本发明的第二个目 的提出索拉非尼耐药标记物在非治疗目的的索拉非尼用药研究中的应用。 本发明的第三个 目的是， 提供该索拉非尼耐药标记物相关试剂的一些应用， 该标记物的相关试剂包括： 检测 其表达的定量试剂、 抑制剂等， 这些相关试剂的应用能够填补肝癌精准诊疗领域的空白。 [0005]本发明的目的是这样实现的： [0006]本发明的第一方面： 发现CTNNB1及以CTNNB1为核心的一组基因PIK3CA、 HNRNPUL2 ‑ BSCL2、 PAXIP1、 CDKL5、 LZTFL1、 S1PR2、 KLHL11、 RP11 ‑159G9.5、 FAM171A2、 ZBED6、 PELI1、 PRIM1的高表达与索拉非尼耐药相关。 因此这些基因表达能够作为指导原发性肝癌治疗的 潜在生物标记物。 即提供了一组索拉非尼耐药标记物， 所述索拉非尼耐药标记物为CTNNB1 或者是与CTNNB1相关联的一组标记物中的任意一种， 所述与CTNNB1相关联的一组标记物 为 PIK3CA、 HNRNPUL2 ‑BSCL2、 PAXIP1、 CDKL5、 LZTFL1、 S1PR2、 KLHL11、 RP11 ‑159G9.5、 FAM171A2、 ZBED6、 PEL I1、 PRIM1。 所述索拉非尼耐药 标记物为RNA或其逆转录的cDNA， 或蛋白。 [0007]具体筛选过程为： [0008]发明人收集了多例原发性肝癌患者的手术标本， 多点取样， 通过三维培养的方法， 成功建立了涵盖数百个位点的肝癌类器官生物库。 团队通过苏木精 ‑伊红(Hematoxylin ‑ Eosin， HE)染色， 证实类器官保留了患者的病理学特征。 通过对类器官和对应的患者标本的 免疫荧光、 免疫组化染色， 发现肝癌类 器官与临床上肝癌 患者的分子标记 物也是一 致的。 [0009]选取近百个位点， 进行组织和对应类器官的外显子、 转录组测 序， 分析了组织与对说　明　书 1/5 页 3 CN 114959035 A 3